卷第一孔志约序梁·陶隐居序合药分剂料理法卷第二诸病通用药疗风通用风眩头面风中风脚弱久风湿痹贼风挛痛暴风瘙痒伤寒大热劳复温疟中恶霍乱转筋呕大腹水肿肠下痢大便不通小便淋小便利溺血消渴黄胆上气咳嗽呕吐痰饮宿
序一序二卷一运气（上）太极图论阴阳体象五行生成数解五行统论每日气数百刻六千分解四季日躔宿度昼夜长短刻数二十四气七十二候斗纲解十二辰次六合解二十八宿过宫歌二十八宿说中星岁差考奎壁角轸天地之门户说气数统论
内容提要生理学合参卷一一、西医生理学脑血液皮肤消化器循环器呼吸器排泻器神经系五官器生殖器二、中医生理学五脏六腑此外病理学合参卷二一、热二、痛三、血四、呕吐五、谵语六、泻七、肿，胀八、汗九、头痛十、咳嗽
序上卷正体主治大法扑伤之症治验血脱烦躁血虚发躁气虚血热瘀血泛注瘀血作痛肝火作痛肝火忿怒肝火胁胀肝胆虚症血虚腹痛气虚不溃寒凝不溃脾虚不敛血虚筋挛肾虚气逆湿热乘肝肝经郁火痛伤胃呕药伤胃呕气血不损行气之非下
叙卷之一咽喉大纲论喉舌分经说咽喉看治法总要十六绝症又四绝症右手图左手图针穴图卷之二精选应用诸方（九方）制药法（四法）爰采应用诸方（十二方）卷之三咽喉门第一（十一症图说）帘珠喉呛食哑喉内外肿喉风热喉紫色
序一序二卷上例言卷上杂症中风章伤风章中寒章暑病章注夏章湿症章火症章内伤章伤食章六郁章气病章痰病章咳嗽章干咳喘病章哮病章疟病章霍乱章泄泻章痢疾章呃逆章卷中杂症痞块积聚章呕吐恶心章噎膈反胃章吞酸吐酸章水肿
秘传外科方
卷首集例先天图说天地人物气候相应说天地人物气候相应图释方历代医学姓氏三代以前，圣君贤相，创为医药，以济死生者也。秦汉以后，有通经博史，修身慎行，闻人巨儒，兼通乎医。医极其明者也。以医为业，世代相承者也
序一序二序三序四凡例十六则劝医六则七方论十剂论辟陶隐居十剂内增入寒热二剂论辟缪仲醇十剂内增升降二剂论卷之一（宫集）人参黄芪甘草白术苍术熟地生地当归牛膝远志石菖蒲卷之二（商集）天门冬麦门冬五味子菟丝子甘
序校刊目经大成序魏序李序兄序自序卷首脏腑表里三阳三阴轮廓贯通（图缺）五运之图（图缺）六气之图（图缺）五轮主属形图（图缺）五轮定位形图（图缺）八廓定位形图（图缺）八廓分属形图（图缺）开导前面针穴图（图缺